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根据上述职责，武隆县农业局内设5个职能科（室）：
（一）办公室（挂纪检监察室牌子）
    1、协助局领导处理日常工作，协调机关政务和业务工作，负责文秘、档案、信访、机要、保密、政务信息、目标管理、提案办理及综合性服务工作；组织制定机关内部规章制度并监督实施；负责农业宣传报道工作。
    2、负责局机关及职能事业单位干部职工的编制、机构、工资等管理工作；负责办理干部职工的考核、奖惩、任免、调配、晋职、晋级和工资福利等事宜；负责办理工作人员的离退休手续及其管理工作；负责安排全县农业系统工作人员的岗位培训、调训、轮训工作，协助局领导抓好机关政治学习和政治思想工作；负责办理机关党务和精神文明建设工作；负责农业系统专业技术职称评聘管理工作；负责社会治安综合治理和计划生育工作。
    3、负责本系统纪检、监察和党风廉政建设。
（二）财务科
    负责编报和执行局部门财政预算；负责局机关财务工作，管理局各项资金；指导局属单位的财务工作；监督管理局属单位的国有资产保值增值，行使直属单位国有资产产权代表职责；指导国有良种场等相关企业的经营管理；指导局系统兴办经济实体及经济体制改革工作。
（三）政策法规科（挂行政执法队牌子）
    负责法律、法规、规章的宣传培训；负责全局系统行政执法的组织、协调、监督；负责局规范性文件的审核；参与法规征求意见稿和有关规范性文件的讨论、修改；负责办理行政复议、行政应诉和行政赔偿案件。
（四）科教科
    拟定农业科技、教育发展规划和计划；指导乡（镇）农业服务体系建设和管理等工作；负责农业科技人员的专业知识更新的培训任务；组织协调重大科研项目的攻关、技术开发与示范推广；负责乡（镇）农业示范场项目的组织规划、实施、验收和经费监督管理工作；申报、登记、管理科技成果，负责农业知识产权保护，组织农业植物新品种保护；负责绿色食品的开发、认证和管理工作，监督农业投入品和农产品质量，组织农业各产业的质量认证和名优特农副产品的登记及申报，实施农业名牌战略；搜集、整理、传递农业科学技术情报和相关科技信息。
（五）产业科（挂武隆县蚕桑生产办公室牌子）
    负责贯彻执行国家有关农业产业发展的方针、政策、拟定全县农业产业发展的规划和策略；负责协调建设农业产业化基地，引进适宜的产业化运作机制，培植龙头企业；负责蚕桑生产技术指导与服务及其产业化建设；负责开展农业产业化知识培训及国内外合作，收集发布农业产业信息；负责指导和管理农业产业企业，开展调查研究和统计报表；负责农产品产、供、销和贸、工、农一体化的协调和管理。
    机关党组织按规定设置，负责机关党的建设工作。
下属事业单位 
    （一）武隆县农业综合服务中心
    （二）武隆县农业广播电视学校
    （三）武隆县农业机械管理站
    （四）武隆县植保植检土肥中心
    （五）农村能源办公室
    事业单位人事制度改革，按《武隆县事业单位人事制度改革总体实施意见》（武人发[2001]21号）规定，及时上报改革方案，经批准后实施。

主办：武隆农业局 承办：武隆农技站
技术支持：重庆为农业信息中心